Após o fim das Stone Wars, os ex-membros do Império do Poder de Tsukasa unem forças com o Reino da Ciência para construir um navio capaz de navegar o oceano em busca de respostas sobre o mistério da petrificação global. Entretanto, antes que eles possam começar sua viagem, Senku e seus amigos precisam encontrar alguns recursos importantes e impulsionar alguns novos avanços científicos para construir o tipo de embarcação que precisam.